作为中国故土的巴尔喀什湖，今日全境都位于哈萨克斯坦共和国境内，同时它也是中亚地区仅次于里海和咸海的第三大内陆湖泊。
但如今，这片为中亚民族提供了宝贵水源的大湖，却在面临干涸的风险。如果不加治理，恐怕会成为下一个咸海。
位于哈萨克斯坦东南部巴尔喀什—阿拉果尔低地内的巴尔喀什湖，被萨雷伊希科半岛分成东西两部分。命名简单粗暴，西部称西巴尔喀什湖，东部称东巴尔喀什湖。
巴尔喀什湖有着非常明显的咸淡分区：它的东部因地处内陆，降水稀少，蒸发旺盛，所以盐度较高为咸水；它的西部虽同样有前述条件，但是有大量河水（主要是伊犁河水）注入，起到了稀释作用，所以盐度较低为淡水。
向北突出的小半岛，只为东西两湖留下了一条狭窄的湖峡，阻碍了东西湖水的畅快交流；同时，整个湖泊湖水较浅，而且每年有长约5个多月的结冰期，这些条件都不利于东西湖水之间的交流。
但这并不妨碍巴尔喀什湖流域为哈萨克斯坦和中国新疆西北部提供宝贵的水资源。
巴尔喀什湖的流域囊括了哈国境内的阿拉木图州、东哈萨克斯坦州的南部、卡拉干达州的东南部、江布尔州的东部和中国伊犁地区。
其中的巴尔喀什——阿拉湖流域是中亚地区一道独特的景观生态系统，这里生活着哈萨克斯坦20%的居民，集中了哈国22%的水资源和42%的水力资源。
值得注意的是，巴尔喀什湖还是其附近地区各河流共同的尾闾湖，它一共有五条固定河流，伊犁河、卡拉塔尔河、阿克苏河（与南疆的阿克苏河同名）、列普瑟河、阿亚古兹河，其中发源于天山山脉中部的伊犁河为其第一大河流。
这片广袤流域的光热资源十分充足，属于极端干旱的大陆性气候。而它的气候也随着季节有着显著差异：冬春季受大西洋、地中海、里海和黑海湿润气流的直接影响，形成比较丰富的降水；但到了夏秋季，就会受到伊朗高原和中亚荒漠干热气流的影响，十分干旱。
同时在整个流域的地理环境中，垂直景观表现得十分鲜明，流域内依次分布着高山冰川带、亚高山草原带、森林草原带、半荒漠和荒漠草原带、绿洲、盐碱地和沙漠、湖泊、沼泽。
但到了每条河的中下游，尤其是巴尔喀什湖的南岸和东岸，生态却显得极为单一，广泛分布着固定和半固定的沙漠和盐碱地。只有在集中于河流下游和河口三角洲的小湖泊，给这里带来了丝丝生机。
倔强坚守在干旱气候中的巴尔喀什湖，主要是依靠高山输送干净的河水以维持生命。然而，将近100年的现代开发史已经改变了它。
沙俄攫取巴尔喀什湖之后，这里很长一段时间内还依旧维持着原有的自然生态，人类的活动主要是哈萨克人的日常游牧生活，对生态的影响几乎和古代相比区别不大。
不过，随世界工业化水平的加速进程，巴尔喀什湖流域的水利资源迟早是要被开发的。
十月革命前，这里仅有灌溉面积2900平方公里，革命之后，尤其是1927年开始，苏联开始着手对遥远的中亚土地做改造，以扩充这个新生大国的粮仓。
到了二战结束之后，苏联在发展畜牧业的同时，以大力垦荒灌溉、开发电力、水运和渔业为目的，对每条河流流域都进行了规划，建立了阿克达拉灌区、卡普恰盖水电站、大阿拉木图灌渠等枢纽性水利工程。
其中最著名的当属卡普恰盖水利水电枢纽工程，这一宏大水利枢纽工程建成于1970年，以发电、灌溉、航运和渔业为目的。它解决了哈萨克斯坦阿拉木图州（原塔尔迪库尔干州）和吉尔吉斯斯坦共和国首都比什凯克的工业、农业和民用电问题。
然而，这座全地区最大的多年调节水库总库容几乎为注入巴尔喀什湖径流量的两倍，对湖泊水文情势产生了重大影响。
其实在该水库设计修建之时的上世纪60年代，就曾出现过关于修水库好不好的争论。但当时大多数人都被湖面水位接近百年最高值（343米）的现象所迷惑，认为修建水库非常合理，而那些不愿苟同的专家则因为政治觉悟不过关而被排挤，离开了苏联水利的核心圈层。
1970年，水电站正式竣工，水库也开始蓄水，计划在1985年将水库蓄满。然而，三年之后，人们就发现恐怕没办法实现设计之初的充水进度，因为过去的高水位只是一种周期性的现象，水库的储量对正常的巴尔喀什湖来说太过分了。
几乎与此同时，巴尔喀什湖体的水位也急剧下降。苏联专家紧急放慢了充水速率，但湖面水位仍以较大速率下降。后来哈萨克斯坦的伊犁-巴尔喀什问题课题组就认为，巴尔喀什湖水位下降的2.36米中有1.1米是因卡普恰盖水库而降低的，将近一半了。
水库的基本功能是要起调蓄作用，而非消耗水资源。但卡普恰盖水库却因水面过于庞大，造成每年蒸发损失高达约10亿立方米。此外，每年从卡普恰盖水库扬水灌溉钦基利德灌区的水量还有约1.7亿立方米。
同时，卡普恰盖水库还明显影响着伊犁河径流量的年内分配，给伊犁河下游地区，特别是伊犁河河巴尔喀什湖的生态环境造成了很大影响。
诸多农业灌溉水利工程的发展也影响着这一流域的局地气候。除了直接耗水之外，引水灌渠使得流域水体及土壤含水量增加。
一方面，水分最终以蒸发的形式输送给大气，增加了水循环过程中的水汽含量，导致陆面水文过程发生改变；另一方面，土地利用的增加使得植被覆盖率和土壤含水量增加，致使到达地面的太阳净辐射增强，土壤热容量增大、储热能力加强，对地表温度的调节速率减缓，最终影响陆气相互作用。
所以虽然这些工程改良了哈萨克斯坦的农耕灌溉系统，却也为该地区的水资源量、水情和水质造成了不可挽回的负面影响。
卡普恰盖水库对于维持巴尔喀什湖水量平衡的也有一定的正面作用。依据相关研究，假设上世纪70年代以后人类并未对流域进行一系列工程建设，此时的巴尔喀什湖也进入了自然退湖期。
具有巨大调蓄作用的水库可以在丰水年接收多余的水来保持巴尔喀什湖水位不至偏高，在枯水年向下游防水以维持湖泊水位稳定。
其实如果合理规划利用水资源，反而能做到在巴尔喀什湖自然衰减的状态下保护湖泊。人们也逐渐明白了这一道理，1986年苏联环保委员会在专门的会议上批准了哈萨克斯坦关于巴尔喀什湖环境保护的一系列综合措施。
首先是严格限制粗放式发展的灌溉农业，灌溉面积不得突破当时的面积，增产途径应立足于对已开垦土地的综合改造，其次是调拨给灌溉系统的总水量不允许超出已到达的值。
这些措施方案在后来部分获得了实施，巴尔喀什湖水位也先达到稳定，后略有上升。但是，由于人口增长，整个湖区的总灌溉面积还是在逐年扩大，之前短期内上升的水位，后来也被逐渐抵消掉了。
伴随着水位下降的另一个难题就是水质污染。在哈萨克斯坦围绕大湖绿洲建设工商业城市之后，巴尔喀什湖沿岸城市以及北岸的工业工矿企业排出的废水和废气日渐稠密，湖区存水的稀释水平又不足，湖水矿化度难免升高。如今巴尔喀什湖中的各种重金属含量增加，湖面上二氧化硫聚集的程度也慢慢变得严重。
这些不良开发措施在影响到流域水体本身的同时，也间接引发了其他的不良反应。
之前巴尔喀什湖相当丰富的动植物群，生物多样性已经大幅度减少，ECO的脆弱性增加；当地的自然景观也由此改变，局地气候也遭受负面影响，盐碱地面积陡增3~4倍，高山区的积雪和冰川也受到污染。
4.龙爱华, 邓铭江, 谢蕾, & 李湘权. (2013). 巴尔喀什湖水量平衡研究. 中国水利学会2013学术年会论文集——S2湖泊治理开发与保护.
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